Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MYBPC1Q00872 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms