Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
EFNB1P98172 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
EFNB1P98172 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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