Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IRX1P78414 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms