Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVPABLB-1P60509 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVPABLB-1P60509 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms