Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD23AP54725 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms