Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSK3BP49841 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms