Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNTBP49356 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FNTBP49356 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms