Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIA4P48058 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms