Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRPPRCP42704 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRPPRCP42704 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms