Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CASP2P42575 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CASP2P42575 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CASP2P42575 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms