Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5C1P36542 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms