Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GABRB3P28472 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GABRB3P28472 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms