Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD10P28358 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD10P28358 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms