Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NFKBIAP25963 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms