Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT1P21579 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT1P21579 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT1P21579 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT1P21579 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT1P21579 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT1P21579 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYT1P21579 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SYT1P21579 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYT1P21579 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT1P21579 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT1P21579 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT1P21579 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT1P21579 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT1P21579 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT1P21579 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYT1P21579 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms