Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRIM21P19474 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRIM21P19474 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms