Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNAP12004 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNAP12004 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNAP12004 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNAP12004 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCNAP12004 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCNAP12004 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCNAP12004 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCNAP12004 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCNAP12004 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNAP12004 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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