Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
NMBP08949 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NMBP08949 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
NMBP08949 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NMBP08949 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NMBP08949 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NMBP08949 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NMBP08949 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
NMBP08949 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NMBP08949 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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NMBP08949 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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NMBP08949 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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NMBP08949 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
NMBP08949 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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