Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POP4O95707 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POP4O95707 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POP4O95707 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms