Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAPGEF3O95398 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAPGEF3O95398 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
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