Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GABARAPO95166 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
GABARAPO95166 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms