Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F6O75461 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F6O75461 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F6O75461 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms