Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FOXO3O43524 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms