Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSH5O43196 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSH5O43196 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSH5O43196 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MSH5O43196 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MSH5O43196 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MSH5O43196 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MSH5O43196 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 MITD1-201ENST00000289359 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 TVP23B-209ENST00000581733 1258 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MSH5O43196 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC242988.1-201ENST00000611044 714 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 PSMC1P6-201ENST00000477233 1319 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MSH5O43196 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSH5O43196 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSH5O43196 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSH5O43196 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSH5O43196 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSH5O43196 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MSH5O43196 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSH5O43196 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSH5O43196 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MSH5O43196 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms