Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.222e-8■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.263e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 FLOT1-208ENST00000470643 852 ntTSL 320.49■□□□□ 0.873e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 FLOT1-210ENST00000484168 1101 ntTSL 520.49■□□□□ 0.873e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.721e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 FLOT1-211ENST00000484693 1001 ntTSL 218.26■□□□□ 0.513e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 CD151-214ENST00000528867 545 ntTSL 417.5■□□□□ 0.391e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 RAPGEF5-211ENST00000497668 383 ntTSL 316.62■□□□□ 0.251e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 CD151-217ENST00000530320 648 ntTSL 313.43□□□□□ -0.261e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.111e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.191e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.441e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.611e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 PABPN1-208ENST00000557702 778 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.991e-9■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 PAXBP1-206ENST00000464256 1692 ntTSL 1 (best)23.97■■□□□ 1.433e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.233e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 PAXBP1-208ENST00000472588 1410 ntTSL 1 (best)21.96■■□□□ 1.113e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 PAXBP1-204ENST00000443785 2920 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.763e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.193e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 WDR33-203ENST00000408998 583 ntTSL 419.75■□□□□ 0.753e-11■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.023e-11■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 WDR33-205ENST00000436787 822 ntTSL 513.12□□□□□ -0.313e-11■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 WDR33-204ENST00000409658 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.583e-11■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 WDR33-202ENST00000393006 3574 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.643e-11■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 HNRNPR-213ENST00000641107 646 nt15.76■□□□□ 0.114e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.024e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.024e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 HNRNPR-209ENST00000476660 1637 ntTSL 1 (best)14.61□□□□□ -0.074e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.444e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.464e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.464e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 311.4□□□□□ -0.584e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 211.12□□□□□ -0.634e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 511.09□□□□□ -0.634e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-206ENST00000453748 2080 ntTSL 210.52□□□□□ -0.734e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.84e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.18□□□□□ -0.944e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-224ENST00000537798 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.974e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.054e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.074e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-221ENST00000531612 938 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.25□□□□□ -1.094e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-218ENST00000530073 2740 ntTSL 28.09□□□□□ -1.124e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-203ENST00000372052 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.124e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-210ENST00000481782 3659 ntTSL 27.73□□□□□ -1.174e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-223ENST00000534450 632 ntTSL 27.53□□□□□ -1.24e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NASP-214ENST00000527932 650 ntTSL 36.38□□□□□ -1.394e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.286e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.14e-8■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 APOE-204ENST00000446996 737 ntTSL 220.93■□□□□ 0.944e-8■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 APOE-203ENST00000434152 864 ntTSL 219.3■□□□□ 0.684e-8■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 APOE-205ENST00000485628 771 ntTSL 1 (best)15.44■□□□□ 0.064e-8■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.562e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SPIN1-202ENST00000462844 599 ntTSL 220.2■□□□□ 0.829e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SPIN1-203ENST00000469017 2082 ntTSL 219.72■□□□□ 0.759e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SPIN1-206ENST00000485804 814 ntTSL 317.99■□□□□ 0.479e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SPIN1-205ENST00000485565 706 ntTSL 317.05■□□□□ 0.329e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SPIN1-201ENST00000375859 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.369e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.764e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MLX-209ENST00000591024 796 ntTSL 318.39■□□□□ 0.534e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.144e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.24e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MLX-207ENST00000590050 2537 ntTSL 213.62□□□□□ -0.234e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MLX-211ENST00000592717 551 ntTSL 213.51□□□□□ -0.254e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MLX-205ENST00000586393 851 ntTSL 511.89□□□□□ -0.514e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MLX-208ENST00000590084 666 ntTSL 311.47□□□□□ -0.574e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MLX-204ENST00000585403 1068 ntTSL 1 (best)10.45□□□□□ -0.744e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MLX-210ENST00000591195 514 ntTSL 37.18□□□□□ -1.264e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.259e-10■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 ACSS2-221ENST00000493250 693 ntTSL 212.43□□□□□ -0.429e-10■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 TMEM94-232ENST00000585105 5632 ntTSL 214.92□□□□□ -0.021e-6■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 TMEM94-217ENST00000581085 5432 ntTSL 213.19□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.351e-6■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.481e-6■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 TMEM94-202ENST00000375248 4703 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-6■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 FKBP10-205ENST00000487489 578 ntTSL 216.6■□□□□ 0.254e-16■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.312e-6■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-6■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 58.77□□□□□ -1.012e-6■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.62e-6■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 FNDC3B-207ENST00000469491 2916 ntTSL 217.44■□□□□ 0.384e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SORL1-205ENST00000527649 1765 ntTSL 213.35□□□□□ -0.272e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SORL1-206ENST00000527934 3032 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.62e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.862e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SORL1-209ENST00000530365 983 ntTSL 59.69□□□□□ -0.862e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 SORL1-212ENST00000534286 3501 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.072e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.272e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 211.41□□□□□ -0.582e-9■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 FAM57A-206ENST00000574327 852 ntTSL 327.17■■□□□ 1.946e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.586e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.46e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MYCBP2-209ENST00000491491 649 ntTSL 523.5■■□□□ 1.356e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.86e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 NRSN2-204ENST00000492242 846 ntTSL 220.05■□□□□ 0.86e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 HSPA8-213ENST00000530391 648 ntTSL 319.71■□□□□ 0.756e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.746e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.686e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.316e-7■□□□□ 9.8
PRPF4O43172 AAAS-215ENST00000549983 860 ntTSL 316.09■□□□□ 0.176e-7■□□□□ 9.8
Retrieved 100 of 20,551 protein–RNA pairs in 102.1 ms