Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FANCAO15360 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCAO15360 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FANCAO15360 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms