Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CEP290O15078 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CEP290O15078 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms