Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC162PA2VCL2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms