Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC78A2IDD5 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms