Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CAB39Q9Y376 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CAB39Q9Y376 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms