Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RIMS3Q9UJD0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms