Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HCN3Q9P1Z3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms