Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RDH8Q9NYR8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
RDH8Q9NYR8 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
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