Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
STRN4Q9NRL3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms