Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
A4GALTQ9NPC4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms