Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
SNHG12Q9BXW3 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 METAP1-201ENST00000296411 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SNHG12Q9BXW3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms