Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HIRIP3Q9BW71 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms