Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYT17Q9BSW7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYT17Q9BSW7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYT17Q9BSW7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYT17Q9BSW7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYT17Q9BSW7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYT17Q9BSW7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYT17Q9BSW7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYT17Q9BSW7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYT17Q9BSW7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SYT17Q9BSW7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 SFT2D2-202ENST00000367829 491 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SYT17Q9BSW7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms