Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EBF4Q9BQW3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms