Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRPF18Q99633 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms