Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms