Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms