Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NMD3Q96D46 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms