Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC71Q8IV32 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC71Q8IV32 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms