Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms