Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATG16L1Q676U5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATG16L1Q676U5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms