Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRAMEF17Q5VTA0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms