Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC27A3Q5K4L6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC27A3Q5K4L6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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