Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SFT2D3Q587I9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms