Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms